Mission 0

目的：逃离医院

任务目标：

1. 不发动反射模式完成任务
2. 与山猫汇合后，不让火男发动一次攻击完成任务

Mission 1

目的：营救被苏联军队抓住的过去的同伴和平·米勒

任务目标：

1. 确定和平·米勒的所在位置
2. 回收和平·米勒
3. 回收瓦库辛多分基地的队长
4. 不被“骷髅”部队发现完成任务
5. 回收斯普古玛伊离宫中的钻石原石
6. 回收运输卡车的驾驶员

Mission 2

目的：与山猫完成母基地运用基础教学

任务目标：

1. 完成富尔顿回收系统运用教学
2. 回收成员，并提升研究开发班等级
3. 开发纸箱，并完成基础教学
4. 完成拘束教学
5. 完成打击教学

此时相当于完成了《潜龙谍影5：幻痛》的所有序章与教学部分，可以正式自由行动。此时建议各位玩家在继续主线任务前先完成支线任务1，回收一名俄语翻译，之后就可以从敌人口中套出有用的情报。虽然并不影响主线任务的展开，但是会帮助大家更好地攻略与理解游戏。

Mission 3

目的：清除在阿富汗焦土作战中暗中活跃的阿尔法小组小队长

任务目标：

1. 清除阿尔法小组小队长
2. 远距离使阿尔法小组小队长无力化（距离100米以上）
3. 回收阿尔法小组小队长
4. 在夏果村庄与斯普古玛伊离宫之间的沙漠中采取Haoma草
5. 回收夏果村庄中隐藏的资源

Haoma草

Mission 4

目的：破坏苏联军的通信设备，切断据点间的增援系统

任务目标：

1. 定位东部通信所的通信设备
2. 破坏东部通信所的通信设备
3. 回收东部通信所周围隐藏的钻石原石
4. 破坏东部通信所的通信机
5. 回收2名被监禁在威亚罗村庄中的俘虏
6. 回收东部通信所中的资源集装箱

Mission 5

目的：回收企图从苏联军中央基地逃亡，被监禁在瓦库·辛多分基地中的假肢开发者

任务目标：

1. 回收被抓获的技术员
2. 用富尔顿系统通过地下设施天花板上的洞回收技术员
3. 回收试图从瓦库辛多分基地逃走的俘虏
4. 回收据点之间巡逻的吉普车
5. 从瓦库辛多分基地获得开发资料

任务3、4、5完成其中任意两个，就可在任务列表中刷新出任务6。