在三个周目的路线中，有的支线任务是共同的，而有的则出现在特定周目，下面就介绍一下在抵抗军营地中能够接到的支线任务。
| 任务 | 对应周目 | 指南 |
| 道具商人的委托 | 一/二周目 | 主线必做任务，并且一/二周目都需要做一次。前往指定位置收集素材即可。 |
| 武器商人的委托 | 一/二周目 | 主线必做任务，并且一/二周目都需要做一次。前往指定位置收集素材即可。 |
| 管理员的委托 | 一/二周目 | 管理员是抵抗军基地内部一个坐在铁网门门前的人，完成他的任务才可以进入仓库。目标是在游乐园拿到一个音乐盒。 |
| 失踪抵抗军 | 一/二周目 | 需要完成“管理员的委托”。调查储藏设施墙上的坐标后，来到沙漠干掉一个35级的机器人，回到营地报告任务，之后过一段时间回来调查即可完成。 |
| 仓库管理员 | 一/二周目 | 需要完成“管理员的委托”。 |
| 仓库管理员2 | 三周目 | 需要完成“仓库管理员”。 |
| 仓库管理员3 | 三周目 | 需要完成“仓库管理员2”。 |
| 照片 | 一/二周目 | 接到任务后需要前往三个地点，一个是游乐园剧院的门口，一个是森林的瀑布，最后一个是沙漠的绿洲。前往绿洲的时候如果碰到了地图边界，就需要往右边蹭，看到椰子树就继续往目标点笔直前进。 |
| 营地发展 | 一/二周目 | 需要在能前往森林之后才可以接这个任务，消灭森林营地中的敌人即可。完成此任务后自动开启“安妮莫宁的过去”。 |
| 安妮莫宁的过去 | 一/二周目 | 需要完成“营地发展”。去工厂的对应范围内拿到数据芯片即可。     |
| 迪瓦菈的请托 | 三周目（A2） | 在抵抗军基地就能看到迪瓦菈和波波菈。 |
| 波波菈的要事 | 三周目（A2） | 需要完成“迪瓦菈的请托”。 |
| 迪瓦菈·波波菈的杂务 | 三周目（A2） | 需要完成“波波菈的要事”。 |
| 同胞们的去向 | 三周目（9S） | 需要先完成任务“艾米尔的回忆”，之后在抵抗军基地坐在存档点旁边的男子就是任务提供者。
9S需要拿到四个抵抗军士兵的狗牌。分别是淹没都市“生锈的狗牌”。
工厂废墟“赃物的狗牌”。
游乐园“磨损的狗牌”。
在沙漠干掉两个坦克之后，“染血的狗牌”。
报告后获得报酬，之后从商业设施废墟的电梯向下走，完成任务。 |
